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新疆农业大学设施农业研究所是集设施农业结构与工程、设施农业园区规划、设施园艺作物标准化高效栽培、设施园艺作物安全生产、设施农业装备等研究与开发任务于一身的研究机构。
研究所重点开展设施优质高产栽培、设施结构优化、设施环境调控、设施农业水肥一体化、病虫害防控、设施农产品安全体系构建等方面的基础研究、应用研究和集成示范推广。为自治区设施农业的可持续发展提供理论、技术、成果和智力支撑,形成一批理论、技术、专利等成果。